{"id":101708,"date":"2020-05-06T09:20:12","date_gmt":"2020-05-06T12:20:12","guid":{"rendered":"http:\/\/www.blogdothame.blog.br\/v1\/?p=101708"},"modified":"2020-05-06T09:20:28","modified_gmt":"2020-05-06T12:20:28","slug":"pesquisadores-descrevem-a-deteccao-de-genoma-do-sars-cov-2-com-100-de-confianca","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.blogdothame.blog.br\/v1\/2020\/05\/06\/pesquisadores-descrevem-a-deteccao-de-genoma-do-sars-cov-2-com-100-de-confianca\/","title":{"rendered":"Pesquisadores descrevem a detec\u00e7\u00e3o de genoma do SARS-CoV-2 com 100% de confian\u00e7a"},"content":{"rendered":"

\"Eric\"O professor e pesquisador Eric Aguiar, do Departamento de Ci\u00eancia Biol\u00f3gica e do Centro de Biotecnologia e Gen\u00e9tica, Universidade Estadual de Santa Cruz (UESC) junto com pesquisadores da Universidade Federal da Bahia (UFBA) e da Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG) desenvolveu um\u00a0pipeline\u00a0de Bioinform\u00e1tica otimizado para an\u00e1lise de dados de sequenciamento de nova gera\u00e7\u00e3o de RNAs derivados de amostras de pacientes, especificamente, infectados com o novo coronav\u00edrus.<\/p>\n

Os pesquisadores descrevem a detec\u00e7\u00e3o de um genoma de SARS-CoV-2 atrav\u00e9s do sequenciamento de nova gera\u00e7\u00e3o utilizando a estrat\u00e9gia de metatranscriptoma (ci\u00eancia que estuda a express\u00e3o g\u00eanica de micr\u00f3bios em ambientes naturais) diretamente do swab nasofar\u00edngeo de um caso suspeito de transmiss\u00e3o local de COVID-19, no Brasil. A deple\u00e7\u00e3o do RNA riboss\u00f4mico humano e o uso de uma estrat\u00e9gia de bioinform\u00e1tica desenvolvida otimizada internamente contribu\u00edram para a detec\u00e7\u00e3o bem-sucedida do v\u00edrus.<\/p>\n

\u201cAtrav\u00e9s do sequenciamento direto do material gen\u00e9tico extra\u00eddo de amostras de swab nasal de paciente, n\u00f3s pr\u00e9-processamos e utilizamos de estrat\u00e9gias computacionais otimizadas para reconstru\u00e7\u00e3o de todas as sequ\u00eancias virais presentes na amostra. Adicionalmente, tamb\u00e9m conseguimos identificar sequ\u00eancias derivadas do material gen\u00e9tico de qualquer outro organismo presente na amostra,\u201d relata o professor Aguiar<\/p>\n

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Segundo ele \u201ca vantagem dessa estrat\u00e9gia \u00e9 que permite, teoricamente, a identifica\u00e7\u00e3o de qualquer organismo presente na amostra, n\u00e3o s\u00f3 o COVID-19. O emprego dessa metodologia \u00e9 importante, pois permite n\u00e3o s\u00f3 o monitoramento do novo coronavirus, mas tamb\u00e9m de poss\u00edveis outros pat\u00f3genos associados que podem influenciar nos sintomas e progn\u00f3stico do indiv\u00edduos\u00a0infectados.\u201d<\/p>\n

O mais importante no estudo dos pesquisadores, de acordo com o professor Eric Aguiar \u00e9 que\u00a0 \u201cutilizando essa estrat\u00e9gia, n\u00f3s sequenciamos e identificamos com 100% de confian\u00e7a o COVID-19 em paciente de Feira de Santana, no que acreditamos ter sido o primeiro caso de transmiss\u00e3o comunit\u00e1ria do v\u00edrus na Bahia. O conjunto dos achados desse trabalho foram sumarizados em um artigo cient\u00edfico.\u201d<\/p>\n

O artigo j\u00e1 foi submetido para publica\u00e7\u00e3o e est\u00e1 no momento em revis\u00e3o. Contudo, o conte\u00fado do manuscrito pode ser visualizado atrav\u00e9s do servidor “pr\u00e9-print” da Scielo (https:\/\/preprints.scielo.org\/ index.php\/scielo\/preprint\/ view\/239).<\/p>\n

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O professor visitante Eric Roberto Guimar\u00e3es Rocha Aguiar do Departamento de Ci\u00eancias Biol\u00f3gicas, Centro de Biotecnologia e Gen\u00e9tica, Programa de P\u00f3s-Gradua\u00e7\u00e3o em Gen\u00e9tica e Biologia Molecular da Universidade Estadual de Santa Cruz (UESC), Ilh\u00e9us-BA, Brasil, \u00e9 Doutor em Bioinformatica e lidera o Laborat\u00f3rio de Bioinform\u00e1tica de V\u00edrus (https:\/\/www.biovirlab.com\/).<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

O professor e pesquisador Eric Aguiar, do Departamento de Ci\u00eancia Biol\u00f3gica e do Centro de Biotecnologia e Gen\u00e9tica, Universidade Estadual de Santa Cruz (UESC) junto com pesquisadores da Universidade Federal da Bahia (UFBA) e da Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG) desenvolveu um\u00a0pipeline\u00a0de Bioinform\u00e1tica otimizado para an\u00e1lise de dados de sequenciamento de nova gera\u00e7\u00e3o de […]<\/p>\n","protected":false},"author":2,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_links_to":"","_links_to_target":""},"categories":[1],"tags":[27157,27156,3371,4632],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.blogdothame.blog.br\/v1\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/101708"}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.blogdothame.blog.br\/v1\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.blogdothame.blog.br\/v1\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.blogdothame.blog.br\/v1\/wp-json\/wp\/v2\/users\/2"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.blogdothame.blog.br\/v1\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=101708"}],"version-history":[{"count":1,"href":"https:\/\/www.blogdothame.blog.br\/v1\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/101708\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":101710,"href":"https:\/\/www.blogdothame.blog.br\/v1\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/101708\/revisions\/101710"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.blogdothame.blog.br\/v1\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=101708"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.blogdothame.blog.br\/v1\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=101708"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.blogdothame.blog.br\/v1\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=101708"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}