:: ‘genoma do SARS-CoV-2’

O professor e pesquisador Eric Aguiar, do Departamento de Ciência Biológica e do Centro de Biotecnologia e Genética, Universidade Estadual de Santa Cruz (UESC) junto com pesquisadores da Universidade Federal da Bahia (UFBA) e da Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG) desenvolveu um pipeline de Bioinformática otimizado para análise de dados de sequenciamento de nova geração de RNAs derivados de amostras de pacientes, especificamente, infectados com o novo coronavírus.

Os pesquisadores descrevem a detecção de um genoma de SARS-CoV-2 através do sequenciamento de nova geração utilizando a estratégia de metatranscriptoma (ciência que estuda a expressão gênica de micróbios em ambientes naturais) diretamente do swab nasofaríngeo de um caso suspeito de transmissão local de COVID-19, no Brasil. A depleção do RNA ribossômico humano e o uso de uma estratégia de bioinformática desenvolvida otimizada internamente contribuíram para a detecção bem-sucedida do vírus.

“Através do sequenciamento direto do material genético extraído de amostras de swab nasal de paciente, nós pré-processamos e utilizamos de estratégias computacionais otimizadas para reconstrução de todas as sequências virais presentes na amostra. Adicionalmente, também conseguimos identificar sequências derivadas do material genético de qualquer outro organismo presente na amostra,” relata o professor Aguiar

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